终端

相比与Windows，Liunx的绝大部分操作都离不开终端。

要说它到底是什么，你可以参考Windows里的CMD，它们本质上是同一类功用的东西

总之，这是一个用来输入命令以运行特定指令，程序或者软件的界面

命令行

一般来说，可以终端知道如何去执行的指令，

比如当我向终端输入cd /并回车后，终端知道这是要将“目光”聚焦于当前系统文件夹的/根目录下，然后它就照做了

cd /就可以说是命令行了

命令有很多种，也可以有很多种，总之就是一种通过终端去命令你的电脑系统的指令性质的语言。

发行版 🤔

不同于Windows系统，Liunx系统是在内核的基础上进行编译与分发，从而有了众多发行版。

这里根据不同发行版使用包管理器的类型，简单草率的分为以下系列：

• Debian系，主要使用apt作为包管理器，以Debian本身和Ubuntu为代表
• Red hat系，主要使用dnf/yum作为包管理器，由Red hat公司发行，以Red Hat Enterprise，Fedora以及被收购的centOS为代表
• Arch系，主要使用pacman和AUR作为包管理器，Arch liunx为代表
• NixOS，采用函数式包管理器
• ......

以上只是相对使用较多的Liunx发行版，实际上，Liunx的发行版数量众多，这里根本无法列举。

不过嘛，在生物信息的研究中不太关注Liunx的发行版，就入门而言，只要是个Liunx能运行对应的软件就可以了。

包管理器

一个用于管理软件的“命令”，或者说是“软件商店”。几乎存在于所有的Liunx系统中

以Debian系使用的apt为例：

当你在终端输入sudo apt install gnome-mines后，包管理器就会在它的仓库里搜索gnome-mines这个软件，如果有匹配的项目，就会列出需要安装的包名和对应的依赖，输入y并回车后，软件就会进行安装了。

安装之后，在终端里输入gnome-mines，这个程序就会运行，你会发现，这是一个扫雷的小游戏😄

如果你不想要保留它，那么可以使用命令sudo apt remove gnome-mines来删除它。

这个命令会在里本地安装的软件中搜索名为gnome-mines的软件，如果有匹配上的，则会显示对应的包和依赖项目，输入y后回车就可以删除了。

文件系统

Liunx的文件系统不同于Windows系统，我们熟知的的Windows系统使用的是平行的盘符文件系统，即分为C:/ D:/等，各个盘符互相平行。

而Liunx系统使用的是所有文件[挂载]在根目录上（/ ）

文件权限